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• 1．

  Inference of Genetic Networks from Steady-state and\\ Pseudo Time-series of Single-cell Gene Expression Data using Modified Random Forests 、 S.Kimura, H.Kitajima, M.Tokuhisa, M.Okada 、 Proc. of the 2023 IEEE Symposium Series on Computational Intelligence 、 1巻 （頁 1579 ～ 1586） 、 2023年 、 国際会議proceedings 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 2．

  Inference of Genetic Networks using Random Forests: Performance Improvement using a New Variable Importance Measure 、 S.Kimura, Y.Takeda, M.Tokuhisa, M.Okada 、 Chem-Bio Informatics Journal 、 22巻 （頁 88 ～ 109） 、 2022年 、 学術雑誌 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 3．

  Inference of Genetic Networks using Random Forests: A Quantitative Weighting Method for Gene Expression Data 、 S.Kimura, K.Sota, M.Tokuhisa 、 Proc. of the 2022 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology 、 1巻 （頁 123 ～ 130） 、 2022年 、 国際会議proceedings 、 共著 、 英語

• 4．

  Feature Selection using Modified Null Importance 、 S.Kimura, D.Oda, M.Tokuhisa 、 Proc. of the 2021 IEEE Symposium Series on Computational Intelligence 、 1巻 （頁 1 ～ 7） 、 2021年 、 国際会議proceedings 、 共著 、 英語

• 5．

  Detection of Weak Relevant Variables using Random Forests 、 S.Kimura and M.Tokuhisa 、 Proc. of the SICE Annual Conference 2020 （頁 838 ～ 845） 、 2020年 、 国際会議proceedings 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 6．

  Inference of genetic networks from time-series and static gene expression data: combining a random-forest-based inference method with feature selection methods 、 S.Kimura, R.Fukutomi, M.Tokuhisa and M.Okada 、 Frontiers in Genetics 、 11巻 595912号 （頁 1 ～ 11） 、 2020年 、 学術雑誌 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 7．

  Inference of Genetic Networks using Random Forests: Assigning Different Weights for Gene Expression Data 、 S.Kimura, M.Tokuhisa, M.Okada 、 Journal of Bioinformatics and Computational Biology 、 17巻 4号 （頁 1950015 ～ ） 、 2019年 、 学術雑誌 、 共著 、 英語

• 8．

  Feature Selection based on Random Forests and its Application to a Modeling of Sewage Treatment Plant 、 S.Kimura, M.Tokuhisa, A.Uemura, M.Okada 、 Proc of the 24th International Conference on Technologies and Applications of Artificial Intelligence 、 0巻 0号 （頁 1 ～ 6） 、 2019年 、 国際会議proceedings 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 9．

  小型計算機におけるサービス指向発話文解析 、 徳久雅人, 木村周平 、 自然言語処理 、 26巻 3号 （頁 545 ～ 578） 、 2019年 、 学術雑誌 、 査読有り 、 共著 、 日本語

• 10．

  Transcriptionally inducible Pleckstrin homology-like domain family A member 1 attenuates ErbB receptor activity by inhibiting receptor oligomerization 、 S.Magi, K.Iwamoto, N.Yumoto, M.Hiroshima, T.Nagashima, R.Ohki, A.Garcia-Munoz, N.Volinsky, A. von Kriegsheim, Y.Sako, K.Takahashi, B.N.Kholodenko, S.Kimura, M.Okada-Hatakeyama 、 J. of Biological Chemistry 、 293巻 （頁 2206 ～ 2218） 、 2018年 、 学術雑誌 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 11．

  Inference of Genetic Networks Using Random Forests: Use of Different Weights for Time-series and Static Gene Expression Data 、 S.Kimura, M.Tokuhisa and M. Okada-Hatakeyama 、 Proc. of the 18th IEEE International Conference on Bioinformatics and Bioengineering （頁 98 ～ 103） 、 2018年 、 国際会議proceedings 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 12．

  Using A Priori Knowledge after Genetic Network Inference: Integrating Multiple Kinds of Knowledge 、 S.Kimura, K.Kitazawa, M.Tokuhisa, M.Okada-Hatakeyama 、 Chem-Bio Informatics Journal 、 17巻 （頁 53 ～ 71） 、 2017年 、 学術雑誌 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 13．

  Inference of Genetic Networks from Time-series of Gene Expression Levels Using Random Forests 、 S.Kimura, M.Tokuhisa, M. Okada-Hatakeyama 、 Proc. of the 2017 Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology 、 1巻 （頁 22 ～ 27） 、 2017年 、 国際会議proceedings 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 14．

  Genetic Network Inference using Hierarchical Structure 、 S.Kimura, M.Tokuhisa, M.Okada-Hatakeyama 、 Frontiers in Physiology 、 7巻 57号 （頁 1 ～ 12） 、 2016年 、 学術雑誌 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 15．

  Recommending Paragraphs of Wikipedia Pages as a Travel Guide 、 M.Tokuhisa, Y.Ishihara, S.Kimura, K.Oku 、 Proc. of the 9th International Workshop on Computational Intelligence and Applications （頁 57 ～ 62） 、 2016年 、 国際会議proceedings 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 16．

  Simultaneous Execution Method of Gene Clustering and Network Inference 、 S.Kimura, M.Tokuhisa, M. Okada-Hatakeyama 、 Proc. of the 2016 Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology （頁 1 ～ 7） 、 2016年 、 国際会議proceedings 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 17．

  Improvement of Reliabilities of Regulations using a Hierarchical Structure in a Genetic Network 、 S.Kimura, M.Okada-Hatakeyama 、 Proc. of the 2015 International Joint Conference on Neural Networks （頁 485 ～ 491） 、 2015年 、 国際会議proceedings 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 18．

  An Effective Method for the Inference of Reduced S-system Models of Genetic Networks 、 S.Kimura, M.Sato, M.Okada-Hatakeyama 、 IPSJ Transactions on Bioinformatics 、 7巻 （頁 30 ～ 38） 、 2014年12月 、 学術雑誌 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 19．

  A Fast Parameter Estimation Method for Inferring Reduced S-system Models of Genetic Networks 、 S.Kimura, M. Furuta, M. Sato, M. Okada-Hatakeyama 、 Proc. of 2014 International Conference on Information Systems and Computing Technology （頁 45 ～ 50） 、 2014年10月 、 国際会議proceedings 、 査読有り 、 共著 、 英語

• 20．

  Positive Feedback within a Kinase Signaling Complex Functions as a Switch Mechanism for NF-kB Activation 、 H.Shinohara, M.Behar, K.Inoue, M.Hiroshima, T.Yasuda, T.Nagashima, S.Kimura, H.Sanjo, S.Maeda, N.Yumoto, S.Ki, S.Akira, Y.Sako, A.Hoffmann, T.Kurosaki, M.Okada-Hatakeyama 、 Science 、 344巻 （頁 760 ～ 764） 、 2014年 、 学術雑誌 、 査読有り 、 共著 、 英語

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